История происходит через 15 лет после событий «Второго удара», в результате которого погибло миллиарды людей на всей планете, люди находились на грани выживания. Но тех, кто уцелел, ожидали испытания куда страшнее… Земля подвергается нападению огромных неведомых существ, именуемых – «Ангелами», которые появились непонятно откуда. Единственным оружием планеты, способным их остановить, являются человекоподобные роботы – 'Евангелионы', разработанные с помощью новых технологий. Однако, вступать в бой при помощи этих гигантов, могут лишь 14 - ти летние дети, которые способны целиком «подстроить» себя под машину и манипулировать 'Евангелионом', подобно своему телу. Эти необыкновенные дети живут и обучаются в городе Токио-3, в штабе 'NERV' – организации, которая возглавляет оборону Планеты от нападения. У пилотов Рей, Аски и Синдзи крайне сложно складываются отношения. От них зависит судьба человечества и только они способны найти ответ на вопрос кто такие «Ангелы».